Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp54Q8BL06 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp54Q8BL06 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp54Q8BL06 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp54Q8BL06 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp54Q8BL06 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp54Q8BL06 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp54Q8BL06 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp54Q8BL06 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp54Q8BL06 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp54Q8BL06 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp54Q8BL06 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp54Q8BL06 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp54Q8BL06 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp54Q8BL06 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp54Q8BL06 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp54Q8BL06 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp54Q8BL06 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp54Q8BL06 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp54Q8BL06 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp54Q8BL06 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp54Q8BL06 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp54Q8BL06 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp54Q8BL06 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp54Q8BL06 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp54Q8BL06 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp54Q8BL06 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp54Q8BL06 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp54Q8BL06 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp54Q8BL06 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp54Q8BL06 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp54Q8BL06 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp54Q8BL06 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp54Q8BL06 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp54Q8BL06 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp54Q8BL06 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp54Q8BL06 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp54Q8BL06 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp54Q8BL06 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Usp54Q8BL06 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Usp54Q8BL06 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Usp54Q8BL06 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp54Q8BL06 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp54Q8BL06 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp54Q8BL06 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp54Q8BL06 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp54Q8BL06 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp54Q8BL06 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp54Q8BL06 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp54Q8BL06 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp54Q8BL06 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp54Q8BL06 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp54Q8BL06 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp54Q8BL06 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp54Q8BL06 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp54Q8BL06 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp54Q8BL06 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp54Q8BL06 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp54Q8BL06 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp54Q8BL06 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp54Q8BL06 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp54Q8BL06 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp54Q8BL06 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp54Q8BL06 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp54Q8BL06 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp54Q8BL06 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp54Q8BL06 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp54Q8BL06 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp54Q8BL06 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp54Q8BL06 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp54Q8BL06 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp54Q8BL06 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp54Q8BL06 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp54Q8BL06 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp54Q8BL06 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp54Q8BL06 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp54Q8BL06 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp54Q8BL06 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp54Q8BL06 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp54Q8BL06 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp54Q8BL06 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp54Q8BL06 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp54Q8BL06 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp54Q8BL06 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp54Q8BL06 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp54Q8BL06 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp54Q8BL06 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp54Q8BL06 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp54Q8BL06 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp54Q8BL06 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp54Q8BL06 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp54Q8BL06 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp54Q8BL06 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp54Q8BL06 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp54Q8BL06 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp54Q8BL06 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp54Q8BL06 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp54Q8BL06 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp54Q8BL06 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp54Q8BL06 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
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