Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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