Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFS6

Cpped1, Serine/threonine-protein phosphatase CPPED1, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpped1Q8BFS6 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cpped1Q8BFS6 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cpped1Q8BFS6 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cpped1Q8BFS6 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cpped1Q8BFS6 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cpped1Q8BFS6 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Cpped1Q8BFS6 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cpped1Q8BFS6 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cpped1Q8BFS6 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cpped1Q8BFS6 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cpped1Q8BFS6 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cpped1Q8BFS6 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cpped1Q8BFS6 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cpped1Q8BFS6 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cpped1Q8BFS6 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cpped1Q8BFS6 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cpped1Q8BFS6 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cpped1Q8BFS6 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cpped1Q8BFS6 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Cpped1Q8BFS6 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cpped1Q8BFS6 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cpped1Q8BFS6 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cpped1Q8BFS6 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cpped1Q8BFS6 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cpped1Q8BFS6 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cpped1Q8BFS6 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cpped1Q8BFS6 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cpped1Q8BFS6 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cpped1Q8BFS6 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cpped1Q8BFS6 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cpped1Q8BFS6 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cpped1Q8BFS6 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cpped1Q8BFS6 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cpped1Q8BFS6 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cpped1Q8BFS6 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cpped1Q8BFS6 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cpped1Q8BFS6 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cpped1Q8BFS6 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cpped1Q8BFS6 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cpped1Q8BFS6 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cpped1Q8BFS6 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cpped1Q8BFS6 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cpped1Q8BFS6 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cpped1Q8BFS6 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cpped1Q8BFS6 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cpped1Q8BFS6 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cpped1Q8BFS6 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cpped1Q8BFS6 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cpped1Q8BFS6 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cpped1Q8BFS6 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cpped1Q8BFS6 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cpped1Q8BFS6 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Cpped1Q8BFS6 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cpped1Q8BFS6 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cpped1Q8BFS6 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cpped1Q8BFS6 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cpped1Q8BFS6 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cpped1Q8BFS6 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cpped1Q8BFS6 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cpped1Q8BFS6 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Cpped1Q8BFS6 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cpped1Q8BFS6 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cpped1Q8BFS6 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cpped1Q8BFS6 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cpped1Q8BFS6 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cpped1Q8BFS6 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cpped1Q8BFS6 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cpped1Q8BFS6 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Cpped1Q8BFS6 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cpped1Q8BFS6 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cpped1Q8BFS6 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cpped1Q8BFS6 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cpped1Q8BFS6 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cpped1Q8BFS6 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cpped1Q8BFS6 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Cpped1Q8BFS6 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cpped1Q8BFS6 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cpped1Q8BFS6 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cpped1Q8BFS6 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cpped1Q8BFS6 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cpped1Q8BFS6 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cpped1Q8BFS6 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cpped1Q8BFS6 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cpped1Q8BFS6 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cpped1Q8BFS6 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cpped1Q8BFS6 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cpped1Q8BFS6 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cpped1Q8BFS6 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cpped1Q8BFS6 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cpped1Q8BFS6 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cpped1Q8BFS6 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cpped1Q8BFS6 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cpped1Q8BFS6 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cpped1Q8BFS6 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cpped1Q8BFS6 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cpped1Q8BFS6 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cpped1Q8BFS6 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cpped1Q8BFS6 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cpped1Q8BFS6 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cpped1Q8BFS6 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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