Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChfrQ810L3 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChfrQ810L3 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChfrQ810L3 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ChfrQ810L3 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ChfrQ810L3 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ChfrQ810L3 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ChfrQ810L3 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ChfrQ810L3 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ChfrQ810L3 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ChfrQ810L3 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ChfrQ810L3 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ChfrQ810L3 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ChfrQ810L3 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ChfrQ810L3 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ChfrQ810L3 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChfrQ810L3 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChfrQ810L3 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChfrQ810L3 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChfrQ810L3 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChfrQ810L3 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChfrQ810L3 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChfrQ810L3 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChfrQ810L3 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChfrQ810L3 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChfrQ810L3 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChfrQ810L3 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChfrQ810L3 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChfrQ810L3 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChfrQ810L3 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ChfrQ810L3 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ChfrQ810L3 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChfrQ810L3 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChfrQ810L3 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChfrQ810L3 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChfrQ810L3 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChfrQ810L3 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChfrQ810L3 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChfrQ810L3 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChfrQ810L3 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChfrQ810L3 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChfrQ810L3 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ChfrQ810L3 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ChfrQ810L3 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChfrQ810L3 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChfrQ810L3 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ChfrQ810L3 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChfrQ810L3 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChfrQ810L3 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChfrQ810L3 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChfrQ810L3 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChfrQ810L3 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChfrQ810L3 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChfrQ810L3 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChfrQ810L3 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChfrQ810L3 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChfrQ810L3 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChfrQ810L3 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChfrQ810L3 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChfrQ810L3 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChfrQ810L3 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChfrQ810L3 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChfrQ810L3 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChfrQ810L3 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChfrQ810L3 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChfrQ810L3 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChfrQ810L3 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChfrQ810L3 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChfrQ810L3 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChfrQ810L3 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChfrQ810L3 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChfrQ810L3 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChfrQ810L3 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChfrQ810L3 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChfrQ810L3 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChfrQ810L3 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChfrQ810L3 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChfrQ810L3 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChfrQ810L3 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ChfrQ810L3 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChfrQ810L3 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChfrQ810L3 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChfrQ810L3 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChfrQ810L3 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChfrQ810L3 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChfrQ810L3 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChfrQ810L3 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChfrQ810L3 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChfrQ810L3 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChfrQ810L3 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChfrQ810L3 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChfrQ810L3 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChfrQ810L3 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChfrQ810L3 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChfrQ810L3 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChfrQ810L3 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChfrQ810L3 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChfrQ810L3 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChfrQ810L3 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChfrQ810L3 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms