Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU4

Smim19, Small integral membrane protein 19, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim19Q80ZU4 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms