Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZD8

Amigo1, Amphoterin-induced protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo1Q80ZD8 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Amigo1Q80ZD8 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Amigo1Q80ZD8 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Amigo1Q80ZD8 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Amigo1Q80ZD8 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Amigo1Q80ZD8 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Amigo1Q80ZD8 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Amigo1Q80ZD8 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Amigo1Q80ZD8 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Amigo1Q80ZD8 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Amigo1Q80ZD8 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Amigo1Q80ZD8 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Amigo1Q80ZD8 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
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Amigo1Q80ZD8 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Amigo1Q80ZD8 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Amigo1Q80ZD8 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Amigo1Q80ZD8 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Amigo1Q80ZD8 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Amigo1Q80ZD8 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Amigo1Q80ZD8 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
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Amigo1Q80ZD8 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Amigo1Q80ZD8 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
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