Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z71

Tnn, Tenascin-N, mousemouse

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnnQ80Z71 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TnnQ80Z71 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TnnQ80Z71 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TnnQ80Z71 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TnnQ80Z71 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TnnQ80Z71 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TnnQ80Z71 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TnnQ80Z71 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TnnQ80Z71 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TnnQ80Z71 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TnnQ80Z71 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TnnQ80Z71 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TnnQ80Z71 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TnnQ80Z71 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TnnQ80Z71 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TnnQ80Z71 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TnnQ80Z71 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TnnQ80Z71 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TnnQ80Z71 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TnnQ80Z71 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TnnQ80Z71 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TnnQ80Z71 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TnnQ80Z71 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TnnQ80Z71 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TnnQ80Z71 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TnnQ80Z71 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TnnQ80Z71 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TnnQ80Z71 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TnnQ80Z71 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TnnQ80Z71 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TnnQ80Z71 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TnnQ80Z71 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TnnQ80Z71 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TnnQ80Z71 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TnnQ80Z71 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TnnQ80Z71 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TnnQ80Z71 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TnnQ80Z71 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TnnQ80Z71 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TnnQ80Z71 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TnnQ80Z71 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TnnQ80Z71 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TnnQ80Z71 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TnnQ80Z71 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TnnQ80Z71 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TnnQ80Z71 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TnnQ80Z71 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TnnQ80Z71 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TnnQ80Z71 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TnnQ80Z71 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TnnQ80Z71 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TnnQ80Z71 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TnnQ80Z71 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TnnQ80Z71 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TnnQ80Z71 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TnnQ80Z71 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TnnQ80Z71 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TnnQ80Z71 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TnnQ80Z71 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TnnQ80Z71 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TnnQ80Z71 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TnnQ80Z71 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TnnQ80Z71 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TnnQ80Z71 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TnnQ80Z71 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TnnQ80Z71 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TnnQ80Z71 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TnnQ80Z71 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TnnQ80Z71 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TnnQ80Z71 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TnnQ80Z71 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TnnQ80Z71 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TnnQ80Z71 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TnnQ80Z71 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TnnQ80Z71 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TnnQ80Z71 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TnnQ80Z71 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TnnQ80Z71 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TnnQ80Z71 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TnnQ80Z71 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TnnQ80Z71 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TnnQ80Z71 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TnnQ80Z71 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TnnQ80Z71 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TnnQ80Z71 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TnnQ80Z71 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TnnQ80Z71 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TnnQ80Z71 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TnnQ80Z71 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TnnQ80Z71 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TnnQ80Z71 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TnnQ80Z71 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TnnQ80Z71 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TnnQ80Z71 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TnnQ80Z71 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TnnQ80Z71 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TnnQ80Z71 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TnnQ80Z71 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TnnQ80Z71 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TnnQ80Z71 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms