Protein–RNA interactions for Protein: Q80YA8

Crb2, Protein crumbs homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crb2Q80YA8 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Crb2Q80YA8 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Crb2Q80YA8 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Crb2Q80YA8 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Crb2Q80YA8 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Crb2Q80YA8 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Crb2Q80YA8 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Crb2Q80YA8 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Crb2Q80YA8 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Crb2Q80YA8 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Crb2Q80YA8 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Crb2Q80YA8 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Crb2Q80YA8 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Crb2Q80YA8 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Crb2Q80YA8 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Crb2Q80YA8 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Crb2Q80YA8 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Crb2Q80YA8 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Crb2Q80YA8 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Crb2Q80YA8 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Crb2Q80YA8 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Crb2Q80YA8 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Crb2Q80YA8 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Crb2Q80YA8 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Crb2Q80YA8 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Crb2Q80YA8 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Crb2Q80YA8 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Crb2Q80YA8 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Crb2Q80YA8 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Crb2Q80YA8 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Crb2Q80YA8 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Crb2Q80YA8 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Crb2Q80YA8 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Crb2Q80YA8 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Crb2Q80YA8 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Crb2Q80YA8 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Crb2Q80YA8 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Crb2Q80YA8 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Crb2Q80YA8 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Crb2Q80YA8 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Crb2Q80YA8 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Crb2Q80YA8 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Crb2Q80YA8 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Crb2Q80YA8 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Crb2Q80YA8 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Crb2Q80YA8 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Crb2Q80YA8 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Crb2Q80YA8 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Crb2Q80YA8 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Crb2Q80YA8 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Crb2Q80YA8 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Crb2Q80YA8 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Crb2Q80YA8 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Crb2Q80YA8 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Crb2Q80YA8 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Crb2Q80YA8 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Crb2Q80YA8 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Crb2Q80YA8 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Crb2Q80YA8 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Crb2Q80YA8 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Crb2Q80YA8 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Crb2Q80YA8 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Crb2Q80YA8 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Crb2Q80YA8 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Crb2Q80YA8 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Crb2Q80YA8 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Crb2Q80YA8 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Crb2Q80YA8 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Crb2Q80YA8 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Crb2Q80YA8 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Crb2Q80YA8 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Crb2Q80YA8 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Crb2Q80YA8 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Crb2Q80YA8 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Crb2Q80YA8 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Crb2Q80YA8 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Crb2Q80YA8 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Crb2Q80YA8 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Crb2Q80YA8 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Crb2Q80YA8 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Crb2Q80YA8 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Crb2Q80YA8 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Crb2Q80YA8 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Crb2Q80YA8 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Crb2Q80YA8 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Crb2Q80YA8 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Crb2Q80YA8 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Crb2Q80YA8 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Crb2Q80YA8 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Crb2Q80YA8 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Crb2Q80YA8 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Crb2Q80YA8 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Crb2Q80YA8 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Crb2Q80YA8 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Crb2Q80YA8 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Crb2Q80YA8 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Crb2Q80YA8 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Crb2Q80YA8 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Crb2Q80YA8 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Crb2Q80YA8 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms