Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y84

Kdm5b, Lysine-specific demethylase 5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5bQ80Y84 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Kdm5bQ80Y84 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Kdm5bQ80Y84 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Kdm5bQ80Y84 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Kdm5bQ80Y84 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Kdm5bQ80Y84 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Kdm5bQ80Y84 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Kdm5bQ80Y84 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Kdm5bQ80Y84 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Kdm5bQ80Y84 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Kdm5bQ80Y84 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Kdm5bQ80Y84 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Kdm5bQ80Y84 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Kdm5bQ80Y84 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Kdm5bQ80Y84 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Kdm5bQ80Y84 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kdm5bQ80Y84 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kdm5bQ80Y84 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Kdm5bQ80Y84 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kdm5bQ80Y84 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Kdm5bQ80Y84 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kdm5bQ80Y84 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kdm5bQ80Y84 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kdm5bQ80Y84 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kdm5bQ80Y84 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kdm5bQ80Y84 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kdm5bQ80Y84 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kdm5bQ80Y84 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kdm5bQ80Y84 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kdm5bQ80Y84 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kdm5bQ80Y84 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kdm5bQ80Y84 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kdm5bQ80Y84 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kdm5bQ80Y84 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kdm5bQ80Y84 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kdm5bQ80Y84 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Kdm5bQ80Y84 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Kdm5bQ80Y84 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kdm5bQ80Y84 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kdm5bQ80Y84 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kdm5bQ80Y84 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kdm5bQ80Y84 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kdm5bQ80Y84 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kdm5bQ80Y84 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kdm5bQ80Y84 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Kdm5bQ80Y84 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Kdm5bQ80Y84 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Kdm5bQ80Y84 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Kdm5bQ80Y84 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Kdm5bQ80Y84 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Kdm5bQ80Y84 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Kdm5bQ80Y84 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Kdm5bQ80Y84 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Kdm5bQ80Y84 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Kdm5bQ80Y84 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Kdm5bQ80Y84 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Kdm5bQ80Y84 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kdm5bQ80Y84 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kdm5bQ80Y84 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kdm5bQ80Y84 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kdm5bQ80Y84 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kdm5bQ80Y84 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kdm5bQ80Y84 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kdm5bQ80Y84 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kdm5bQ80Y84 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Kdm5bQ80Y84 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kdm5bQ80Y84 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kdm5bQ80Y84 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kdm5bQ80Y84 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Kdm5bQ80Y84 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kdm5bQ80Y84 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kdm5bQ80Y84 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kdm5bQ80Y84 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kdm5bQ80Y84 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kdm5bQ80Y84 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kdm5bQ80Y84 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kdm5bQ80Y84 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kdm5bQ80Y84 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Kdm5bQ80Y84 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kdm5bQ80Y84 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kdm5bQ80Y84 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kdm5bQ80Y84 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kdm5bQ80Y84 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Kdm5bQ80Y84 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kdm5bQ80Y84 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kdm5bQ80Y84 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kdm5bQ80Y84 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kdm5bQ80Y84 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kdm5bQ80Y84 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Kdm5bQ80Y84 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Kdm5bQ80Y84 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Kdm5bQ80Y84 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Kdm5bQ80Y84 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Kdm5bQ80Y84 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Kdm5bQ80Y84 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Kdm5bQ80Y84 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Kdm5bQ80Y84 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kdm5bQ80Y84 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Kdm5bQ80Y84 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kdm5bQ80Y84 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms