Protein–RNA interactions for Protein: Q80UU2

Rpp38, Ribonuclease P protein subunit p38, mousemouse

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Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpp38Q80UU2 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Rpp38Q80UU2 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpp38Q80UU2 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpp38Q80UU2 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Rpp38Q80UU2 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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Rpp38Q80UU2 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpp38Q80UU2 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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Rpp38Q80UU2 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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Rpp38Q80UU2 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpp38Q80UU2 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Rpp38Q80UU2 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpp38Q80UU2 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpp38Q80UU2 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Rpp38Q80UU2 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpp38Q80UU2 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpp38Q80UU2 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpp38Q80UU2 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpp38Q80UU2 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpp38Q80UU2 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpp38Q80UU2 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpp38Q80UU2 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpp38Q80UU2 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpp38Q80UU2 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpp38Q80UU2 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpp38Q80UU2 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpp38Q80UU2 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpp38Q80UU2 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpp38Q80UU2 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpp38Q80UU2 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpp38Q80UU2 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpp38Q80UU2 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpp38Q80UU2 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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