Protein–RNA interactions for Protein: Q7TST5

Lamp3, Lysosome-associated membrane glycoprotein 3, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp3Q7TST5 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Lamp3Q7TST5 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Lamp3Q7TST5 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Lamp3Q7TST5 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Lamp3Q7TST5 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Lamp3Q7TST5 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Lamp3Q7TST5 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Lamp3Q7TST5 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Lamp3Q7TST5 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Lamp3Q7TST5 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Lamp3Q7TST5 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Lamp3Q7TST5 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Lamp3Q7TST5 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Lamp3Q7TST5 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Lamp3Q7TST5 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Lamp3Q7TST5 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Lamp3Q7TST5 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Lamp3Q7TST5 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Lamp3Q7TST5 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Lamp3Q7TST5 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Lamp3Q7TST5 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Lamp3Q7TST5 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Lamp3Q7TST5 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Lamp3Q7TST5 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Lamp3Q7TST5 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Lamp3Q7TST5 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Lamp3Q7TST5 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Lamp3Q7TST5 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Lamp3Q7TST5 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Lamp3Q7TST5 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Lamp3Q7TST5 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Lamp3Q7TST5 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Lamp3Q7TST5 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Lamp3Q7TST5 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Lamp3Q7TST5 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Lamp3Q7TST5 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Lamp3Q7TST5 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Lamp3Q7TST5 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Lamp3Q7TST5 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Lamp3Q7TST5 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Lamp3Q7TST5 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Lamp3Q7TST5 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Lamp3Q7TST5 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Lamp3Q7TST5 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Lamp3Q7TST5 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Lamp3Q7TST5 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Lamp3Q7TST5 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Lamp3Q7TST5 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Lamp3Q7TST5 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Lamp3Q7TST5 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Lamp3Q7TST5 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Lamp3Q7TST5 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Lamp3Q7TST5 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Lamp3Q7TST5 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Lamp3Q7TST5 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Lamp3Q7TST5 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Lamp3Q7TST5 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Lamp3Q7TST5 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Lamp3Q7TST5 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Lamp3Q7TST5 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Lamp3Q7TST5 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Lamp3Q7TST5 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Lamp3Q7TST5 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Lamp3Q7TST5 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Lamp3Q7TST5 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Lamp3Q7TST5 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Lamp3Q7TST5 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Lamp3Q7TST5 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Lamp3Q7TST5 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Lamp3Q7TST5 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Lamp3Q7TST5 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Lamp3Q7TST5 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Lamp3Q7TST5 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Lamp3Q7TST5 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Lamp3Q7TST5 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Lamp3Q7TST5 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Lamp3Q7TST5 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Lamp3Q7TST5 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Lamp3Q7TST5 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Lamp3Q7TST5 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Lamp3Q7TST5 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Lamp3Q7TST5 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Lamp3Q7TST5 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Lamp3Q7TST5 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Lamp3Q7TST5 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Lamp3Q7TST5 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Lamp3Q7TST5 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Lamp3Q7TST5 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Lamp3Q7TST5 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Lamp3Q7TST5 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Lamp3Q7TST5 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Lamp3Q7TST5 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Lamp3Q7TST5 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Lamp3Q7TST5 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Lamp3Q7TST5 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Lamp3Q7TST5 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Lamp3Q7TST5 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Lamp3Q7TST5 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Lamp3Q7TST5 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Lamp3Q7TST5 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms