Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Clec18aQ7TSQ1 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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