Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSK3

Pcdh8, Protocadherin-8, mousemouse

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdh8Q7TSK3 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pcdh8Q7TSK3 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pcdh8Q7TSK3 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pcdh8Q7TSK3 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pcdh8Q7TSK3 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pcdh8Q7TSK3 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pcdh8Q7TSK3 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pcdh8Q7TSK3 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pcdh8Q7TSK3 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pcdh8Q7TSK3 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pcdh8Q7TSK3 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pcdh8Q7TSK3 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pcdh8Q7TSK3 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pcdh8Q7TSK3 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pcdh8Q7TSK3 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pcdh8Q7TSK3 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Pcdh8Q7TSK3 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pcdh8Q7TSK3 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pcdh8Q7TSK3 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pcdh8Q7TSK3 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Pcdh8Q7TSK3 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pcdh8Q7TSK3 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pcdh8Q7TSK3 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pcdh8Q7TSK3 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pcdh8Q7TSK3 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pcdh8Q7TSK3 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pcdh8Q7TSK3 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pcdh8Q7TSK3 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pcdh8Q7TSK3 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pcdh8Q7TSK3 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pcdh8Q7TSK3 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pcdh8Q7TSK3 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Pcdh8Q7TSK3 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pcdh8Q7TSK3 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pcdh8Q7TSK3 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcdh8Q7TSK3 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcdh8Q7TSK3 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcdh8Q7TSK3 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcdh8Q7TSK3 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcdh8Q7TSK3 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcdh8Q7TSK3 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcdh8Q7TSK3 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcdh8Q7TSK3 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcdh8Q7TSK3 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcdh8Q7TSK3 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcdh8Q7TSK3 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcdh8Q7TSK3 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcdh8Q7TSK3 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcdh8Q7TSK3 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcdh8Q7TSK3 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcdh8Q7TSK3 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcdh8Q7TSK3 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcdh8Q7TSK3 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcdh8Q7TSK3 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcdh8Q7TSK3 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcdh8Q7TSK3 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcdh8Q7TSK3 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcdh8Q7TSK3 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcdh8Q7TSK3 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcdh8Q7TSK3 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcdh8Q7TSK3 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcdh8Q7TSK3 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcdh8Q7TSK3 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcdh8Q7TSK3 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcdh8Q7TSK3 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcdh8Q7TSK3 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcdh8Q7TSK3 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcdh8Q7TSK3 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcdh8Q7TSK3 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcdh8Q7TSK3 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcdh8Q7TSK3 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcdh8Q7TSK3 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcdh8Q7TSK3 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcdh8Q7TSK3 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcdh8Q7TSK3 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcdh8Q7TSK3 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcdh8Q7TSK3 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcdh8Q7TSK3 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcdh8Q7TSK3 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcdh8Q7TSK3 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcdh8Q7TSK3 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcdh8Q7TSK3 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcdh8Q7TSK3 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcdh8Q7TSK3 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcdh8Q7TSK3 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcdh8Q7TSK3 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcdh8Q7TSK3 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcdh8Q7TSK3 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Pcdh8Q7TSK3 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pcdh8Q7TSK3 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pcdh8Q7TSK3 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pcdh8Q7TSK3 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pcdh8Q7TSK3 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pcdh8Q7TSK3 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pcdh8Q7TSK3 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pcdh8Q7TSK3 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pcdh8Q7TSK3 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Pcdh8Q7TSK3 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcdh8Q7TSK3 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcdh8Q7TSK3 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms