Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN16

Hhip, Hedgehog-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HhipQ7TN16 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HhipQ7TN16 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HhipQ7TN16 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HhipQ7TN16 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HhipQ7TN16 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HhipQ7TN16 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HhipQ7TN16 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HhipQ7TN16 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HhipQ7TN16 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HhipQ7TN16 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HhipQ7TN16 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HhipQ7TN16 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HhipQ7TN16 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HhipQ7TN16 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HhipQ7TN16 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HhipQ7TN16 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HhipQ7TN16 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HhipQ7TN16 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HhipQ7TN16 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HhipQ7TN16 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HhipQ7TN16 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HhipQ7TN16 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HhipQ7TN16 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HhipQ7TN16 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HhipQ7TN16 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HhipQ7TN16 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HhipQ7TN16 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HhipQ7TN16 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HhipQ7TN16 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HhipQ7TN16 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HhipQ7TN16 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HhipQ7TN16 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HhipQ7TN16 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HhipQ7TN16 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HhipQ7TN16 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HhipQ7TN16 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HhipQ7TN16 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HhipQ7TN16 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HhipQ7TN16 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HhipQ7TN16 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HhipQ7TN16 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HhipQ7TN16 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HhipQ7TN16 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HhipQ7TN16 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HhipQ7TN16 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HhipQ7TN16 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HhipQ7TN16 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HhipQ7TN16 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HhipQ7TN16 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HhipQ7TN16 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HhipQ7TN16 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HhipQ7TN16 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HhipQ7TN16 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HhipQ7TN16 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HhipQ7TN16 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HhipQ7TN16 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HhipQ7TN16 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HhipQ7TN16 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HhipQ7TN16 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HhipQ7TN16 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HhipQ7TN16 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HhipQ7TN16 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HhipQ7TN16 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HhipQ7TN16 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HhipQ7TN16 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HhipQ7TN16 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HhipQ7TN16 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HhipQ7TN16 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HhipQ7TN16 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HhipQ7TN16 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HhipQ7TN16 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HhipQ7TN16 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HhipQ7TN16 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
HhipQ7TN16 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HhipQ7TN16 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HhipQ7TN16 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HhipQ7TN16 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HhipQ7TN16 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HhipQ7TN16 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HhipQ7TN16 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HhipQ7TN16 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HhipQ7TN16 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HhipQ7TN16 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HhipQ7TN16 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HhipQ7TN16 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HhipQ7TN16 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
HhipQ7TN16 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HhipQ7TN16 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HhipQ7TN16 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HhipQ7TN16 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HhipQ7TN16 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HhipQ7TN16 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HhipQ7TN16 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HhipQ7TN16 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HhipQ7TN16 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HhipQ7TN16 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HhipQ7TN16 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HhipQ7TN16 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HhipQ7TN16 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HhipQ7TN16 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms