Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPR5

Smpd4, Sphingomyelin phosphodiesterase 4, mousemouse

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd4Q6ZPR5 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms