Protein–RNA interactions for Protein: Q6YND2

Znf653, Zinc finger protein 653, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf653Q6YND2 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Znf653Q6YND2 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Znf653Q6YND2 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Znf653Q6YND2 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Znf653Q6YND2 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Znf653Q6YND2 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Znf653Q6YND2 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Znf653Q6YND2 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Znf653Q6YND2 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Znf653Q6YND2 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Znf653Q6YND2 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Znf653Q6YND2 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Znf653Q6YND2 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Znf653Q6YND2 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Znf653Q6YND2 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Znf653Q6YND2 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Znf653Q6YND2 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Znf653Q6YND2 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Znf653Q6YND2 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Znf653Q6YND2 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Znf653Q6YND2 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Znf653Q6YND2 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Znf653Q6YND2 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Znf653Q6YND2 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Znf653Q6YND2 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Znf653Q6YND2 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Znf653Q6YND2 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Znf653Q6YND2 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Znf653Q6YND2 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Znf653Q6YND2 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Znf653Q6YND2 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Znf653Q6YND2 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Znf653Q6YND2 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Znf653Q6YND2 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Znf653Q6YND2 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Znf653Q6YND2 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Znf653Q6YND2 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Znf653Q6YND2 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Znf653Q6YND2 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Znf653Q6YND2 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Znf653Q6YND2 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Znf653Q6YND2 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Znf653Q6YND2 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Znf653Q6YND2 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Znf653Q6YND2 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Znf653Q6YND2 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Znf653Q6YND2 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Znf653Q6YND2 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Znf653Q6YND2 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Znf653Q6YND2 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Znf653Q6YND2 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Znf653Q6YND2 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Znf653Q6YND2 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Znf653Q6YND2 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Znf653Q6YND2 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Znf653Q6YND2 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Znf653Q6YND2 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Znf653Q6YND2 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Znf653Q6YND2 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Znf653Q6YND2 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Znf653Q6YND2 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Znf653Q6YND2 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Znf653Q6YND2 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Znf653Q6YND2 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Znf653Q6YND2 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Znf653Q6YND2 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Znf653Q6YND2 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Znf653Q6YND2 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Znf653Q6YND2 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Znf653Q6YND2 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Znf653Q6YND2 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Znf653Q6YND2 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Znf653Q6YND2 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Znf653Q6YND2 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Znf653Q6YND2 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Znf653Q6YND2 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Znf653Q6YND2 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Znf653Q6YND2 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Znf653Q6YND2 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Znf653Q6YND2 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Znf653Q6YND2 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Znf653Q6YND2 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Znf653Q6YND2 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Znf653Q6YND2 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Znf653Q6YND2 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Znf653Q6YND2 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Znf653Q6YND2 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Znf653Q6YND2 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Znf653Q6YND2 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Znf653Q6YND2 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Znf653Q6YND2 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Znf653Q6YND2 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Znf653Q6YND2 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Znf653Q6YND2 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Znf653Q6YND2 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Znf653Q6YND2 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Znf653Q6YND2 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Znf653Q6YND2 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Znf653Q6YND2 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Znf653Q6YND2 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms