Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGF3

Med16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med16Q6PGF3 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Med16Q6PGF3 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Med16Q6PGF3 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Med16Q6PGF3 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Med16Q6PGF3 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Med16Q6PGF3 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Med16Q6PGF3 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Med16Q6PGF3 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Med16Q6PGF3 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Med16Q6PGF3 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Med16Q6PGF3 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Med16Q6PGF3 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Med16Q6PGF3 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Med16Q6PGF3 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Med16Q6PGF3 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Med16Q6PGF3 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Med16Q6PGF3 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Med16Q6PGF3 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Med16Q6PGF3 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Med16Q6PGF3 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Med16Q6PGF3 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Med16Q6PGF3 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Med16Q6PGF3 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Med16Q6PGF3 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Med16Q6PGF3 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Med16Q6PGF3 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Med16Q6PGF3 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Med16Q6PGF3 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Med16Q6PGF3 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Med16Q6PGF3 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Med16Q6PGF3 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Med16Q6PGF3 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Med16Q6PGF3 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Med16Q6PGF3 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Med16Q6PGF3 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Med16Q6PGF3 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Med16Q6PGF3 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Med16Q6PGF3 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Med16Q6PGF3 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Med16Q6PGF3 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Med16Q6PGF3 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Med16Q6PGF3 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Med16Q6PGF3 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Med16Q6PGF3 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Med16Q6PGF3 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Med16Q6PGF3 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Med16Q6PGF3 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Med16Q6PGF3 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Med16Q6PGF3 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Med16Q6PGF3 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Med16Q6PGF3 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Med16Q6PGF3 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Med16Q6PGF3 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Med16Q6PGF3 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Med16Q6PGF3 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Med16Q6PGF3 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Med16Q6PGF3 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Med16Q6PGF3 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Med16Q6PGF3 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Med16Q6PGF3 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Med16Q6PGF3 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Med16Q6PGF3 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Med16Q6PGF3 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Med16Q6PGF3 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Med16Q6PGF3 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Med16Q6PGF3 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Med16Q6PGF3 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Med16Q6PGF3 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Med16Q6PGF3 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Med16Q6PGF3 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Med16Q6PGF3 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Med16Q6PGF3 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Med16Q6PGF3 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Med16Q6PGF3 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Med16Q6PGF3 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Med16Q6PGF3 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Med16Q6PGF3 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Med16Q6PGF3 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Med16Q6PGF3 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Med16Q6PGF3 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Med16Q6PGF3 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Med16Q6PGF3 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Med16Q6PGF3 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Med16Q6PGF3 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Med16Q6PGF3 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Med16Q6PGF3 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Med16Q6PGF3 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Med16Q6PGF3 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Med16Q6PGF3 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Med16Q6PGF3 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Med16Q6PGF3 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Med16Q6PGF3 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Med16Q6PGF3 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Med16Q6PGF3 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Med16Q6PGF3 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Med16Q6PGF3 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Med16Q6PGF3 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Med16Q6PGF3 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Med16Q6PGF3 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Med16Q6PGF3 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 166.3 ms