Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE13

Prrt3, Proline-rich transmembrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 971 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt3Q6PE13 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Gm13899-201ENSMUST00000121519 1255 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Ica1-202ENSMUST00000115518 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Gm16178-201ENSMUST00000129408 677 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Alg13-207ENSMUST00000149330 479 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Gm45574-201ENSMUST00000210921 331 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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