Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDZ2

Taf1c, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1cQ6PDZ2 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms