Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1E7

Primpol, DNA-directed primase/polymerase protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrimpolQ6P1E7 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PrimpolQ6P1E7 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PrimpolQ6P1E7 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PrimpolQ6P1E7 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PrimpolQ6P1E7 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PrimpolQ6P1E7 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PrimpolQ6P1E7 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PrimpolQ6P1E7 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PrimpolQ6P1E7 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PrimpolQ6P1E7 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PrimpolQ6P1E7 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PrimpolQ6P1E7 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PrimpolQ6P1E7 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PrimpolQ6P1E7 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PrimpolQ6P1E7 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PrimpolQ6P1E7 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PrimpolQ6P1E7 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PrimpolQ6P1E7 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PrimpolQ6P1E7 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PrimpolQ6P1E7 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PrimpolQ6P1E7 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PrimpolQ6P1E7 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PrimpolQ6P1E7 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PrimpolQ6P1E7 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PrimpolQ6P1E7 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PrimpolQ6P1E7 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PrimpolQ6P1E7 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PrimpolQ6P1E7 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PrimpolQ6P1E7 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PrimpolQ6P1E7 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PrimpolQ6P1E7 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PrimpolQ6P1E7 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PrimpolQ6P1E7 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PrimpolQ6P1E7 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PrimpolQ6P1E7 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PrimpolQ6P1E7 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PrimpolQ6P1E7 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PrimpolQ6P1E7 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PrimpolQ6P1E7 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PrimpolQ6P1E7 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PrimpolQ6P1E7 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PrimpolQ6P1E7 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PrimpolQ6P1E7 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PrimpolQ6P1E7 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PrimpolQ6P1E7 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PrimpolQ6P1E7 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PrimpolQ6P1E7 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PrimpolQ6P1E7 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PrimpolQ6P1E7 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PrimpolQ6P1E7 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PrimpolQ6P1E7 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PrimpolQ6P1E7 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PrimpolQ6P1E7 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PrimpolQ6P1E7 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PrimpolQ6P1E7 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PrimpolQ6P1E7 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PrimpolQ6P1E7 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PrimpolQ6P1E7 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PrimpolQ6P1E7 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PrimpolQ6P1E7 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PrimpolQ6P1E7 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PrimpolQ6P1E7 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PrimpolQ6P1E7 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PrimpolQ6P1E7 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PrimpolQ6P1E7 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PrimpolQ6P1E7 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PrimpolQ6P1E7 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PrimpolQ6P1E7 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PrimpolQ6P1E7 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PrimpolQ6P1E7 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PrimpolQ6P1E7 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PrimpolQ6P1E7 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PrimpolQ6P1E7 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PrimpolQ6P1E7 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PrimpolQ6P1E7 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PrimpolQ6P1E7 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PrimpolQ6P1E7 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PrimpolQ6P1E7 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PrimpolQ6P1E7 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PrimpolQ6P1E7 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PrimpolQ6P1E7 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PrimpolQ6P1E7 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PrimpolQ6P1E7 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PrimpolQ6P1E7 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PrimpolQ6P1E7 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PrimpolQ6P1E7 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PrimpolQ6P1E7 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PrimpolQ6P1E7 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PrimpolQ6P1E7 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PrimpolQ6P1E7 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PrimpolQ6P1E7 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PrimpolQ6P1E7 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PrimpolQ6P1E7 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PrimpolQ6P1E7 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PrimpolQ6P1E7 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PrimpolQ6P1E7 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PrimpolQ6P1E7 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PrimpolQ6P1E7 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PrimpolQ6P1E7 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PrimpolQ6P1E7 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms