Protein–RNA interactions for Protein: Q6EBV9

Atg9b, Autophagy-related protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9bQ6EBV9 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms