Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Smarca2Q6DIC0 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Smarca2Q6DIC0 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Smarca2Q6DIC0 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Smarca2Q6DIC0 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Smarca2Q6DIC0 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Smarca2Q6DIC0 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Smarca2Q6DIC0 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Smarca2Q6DIC0 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Smarca2Q6DIC0 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Smarca2Q6DIC0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Smarca2Q6DIC0 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Smarca2Q6DIC0 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Smarca2Q6DIC0 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Smarca2Q6DIC0 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Smarca2Q6DIC0 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Smarca2Q6DIC0 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Smarca2Q6DIC0 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Smarca2Q6DIC0 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Smarca2Q6DIC0 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Smarca2Q6DIC0 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Smarca2Q6DIC0 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Smarca2Q6DIC0 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Smarca2Q6DIC0 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Smarca2Q6DIC0 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Smarca2Q6DIC0 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Smarca2Q6DIC0 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Smarca2Q6DIC0 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Smarca2Q6DIC0 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Smarca2Q6DIC0 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Smarca2Q6DIC0 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Smarca2Q6DIC0 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Smarca2Q6DIC0 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Smarca2Q6DIC0 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Smarca2Q6DIC0 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Smarca2Q6DIC0 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Smarca2Q6DIC0 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Smarca2Q6DIC0 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Smarca2Q6DIC0 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Smarca2Q6DIC0 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Smarca2Q6DIC0 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Smarca2Q6DIC0 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Smarca2Q6DIC0 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Smarca2Q6DIC0 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Smarca2Q6DIC0 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Smarca2Q6DIC0 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Smarca2Q6DIC0 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Smarca2Q6DIC0 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Smarca2Q6DIC0 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Smarca2Q6DIC0 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Smarca2Q6DIC0 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Smarca2Q6DIC0 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Smarca2Q6DIC0 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Smarca2Q6DIC0 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Smarca2Q6DIC0 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Smarca2Q6DIC0 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Smarca2Q6DIC0 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Smarca2Q6DIC0 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Smarca2Q6DIC0 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Smarca2Q6DIC0 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Smarca2Q6DIC0 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Smarca2Q6DIC0 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Smarca2Q6DIC0 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Smarca2Q6DIC0 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Smarca2Q6DIC0 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Smarca2Q6DIC0 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Smarca2Q6DIC0 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Smarca2Q6DIC0 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Smarca2Q6DIC0 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Smarca2Q6DIC0 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Smarca2Q6DIC0 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Smarca2Q6DIC0 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Smarca2Q6DIC0 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Smarca2Q6DIC0 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Smarca2Q6DIC0 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Smarca2Q6DIC0 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Smarca2Q6DIC0 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Smarca2Q6DIC0 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Smarca2Q6DIC0 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Smarca2Q6DIC0 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Smarca2Q6DIC0 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Smarca2Q6DIC0 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Smarca2Q6DIC0 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Smarca2Q6DIC0 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Smarca2Q6DIC0 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Smarca2Q6DIC0 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Smarca2Q6DIC0 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Smarca2Q6DIC0 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Smarca2Q6DIC0 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Smarca2Q6DIC0 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Smarca2Q6DIC0 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Smarca2Q6DIC0 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Smarca2Q6DIC0 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Smarca2Q6DIC0 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Smarca2Q6DIC0 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Smarca2Q6DIC0 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Smarca2Q6DIC0 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Smarca2Q6DIC0 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Smarca2Q6DIC0 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Smarca2Q6DIC0 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms