Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn1Q6A0D4 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73 ms