Protein–RNA interactions for Protein: Q6A078

Cep290, Centrosomal protein of 290 kDa, mousemouse

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Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep290Q6A078 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cep290Q6A078 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cep290Q6A078 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cep290Q6A078 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cep290Q6A078 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cep290Q6A078 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cep290Q6A078 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Cep290Q6A078 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cep290Q6A078 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cep290Q6A078 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cep290Q6A078 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cep290Q6A078 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cep290Q6A078 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Cep290Q6A078 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cep290Q6A078 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cep290Q6A078 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cep290Q6A078 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cep290Q6A078 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cep290Q6A078 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cep290Q6A078 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cep290Q6A078 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cep290Q6A078 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cep290Q6A078 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
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Cep290Q6A078 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Cep290Q6A078 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cep290Q6A078 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cep290Q6A078 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cep290Q6A078 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cep290Q6A078 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cep290Q6A078 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cep290Q6A078 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cep290Q6A078 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cep290Q6A078 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Cep290Q6A078 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Cep290Q6A078 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Cep290Q6A078 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cep290Q6A078 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Cep290Q6A078 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Cep290Q6A078 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cep290Q6A078 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cep290Q6A078 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cep290Q6A078 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cep290Q6A078 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cep290Q6A078 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cep290Q6A078 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cep290Q6A078 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cep290Q6A078 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cep290Q6A078 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cep290Q6A078 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cep290Q6A078 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cep290Q6A078 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cep290Q6A078 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cep290Q6A078 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Cep290Q6A078 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cep290Q6A078 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cep290Q6A078 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cep290Q6A078 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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