Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZB8

Zcchc2, Zinc finger CCHC domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc2Q69ZB8 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Zcchc2Q69ZB8 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Zcchc2Q69ZB8 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zcchc2Q69ZB8 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zcchc2Q69ZB8 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zcchc2Q69ZB8 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zcchc2Q69ZB8 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zcchc2Q69ZB8 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zcchc2Q69ZB8 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zcchc2Q69ZB8 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zcchc2Q69ZB8 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zcchc2Q69ZB8 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zcchc2Q69ZB8 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zcchc2Q69ZB8 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zcchc2Q69ZB8 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zcchc2Q69ZB8 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zcchc2Q69ZB8 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zcchc2Q69ZB8 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zcchc2Q69ZB8 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zcchc2Q69ZB8 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zcchc2Q69ZB8 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zcchc2Q69ZB8 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zcchc2Q69ZB8 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zcchc2Q69ZB8 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zcchc2Q69ZB8 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zcchc2Q69ZB8 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zcchc2Q69ZB8 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zcchc2Q69ZB8 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zcchc2Q69ZB8 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zcchc2Q69ZB8 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Zcchc2Q69ZB8 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Zcchc2Q69ZB8 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zcchc2Q69ZB8 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zcchc2Q69ZB8 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zcchc2Q69ZB8 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zcchc2Q69ZB8 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zcchc2Q69ZB8 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Zcchc2Q69ZB8 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zcchc2Q69ZB8 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zcchc2Q69ZB8 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Zcchc2Q69ZB8 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zcchc2Q69ZB8 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zcchc2Q69ZB8 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zcchc2Q69ZB8 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zcchc2Q69ZB8 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zcchc2Q69ZB8 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zcchc2Q69ZB8 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zcchc2Q69ZB8 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zcchc2Q69ZB8 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zcchc2Q69ZB8 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zcchc2Q69ZB8 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zcchc2Q69ZB8 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zcchc2Q69ZB8 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zcchc2Q69ZB8 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Zcchc2Q69ZB8 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zcchc2Q69ZB8 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zcchc2Q69ZB8 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zcchc2Q69ZB8 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zcchc2Q69ZB8 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zcchc2Q69ZB8 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zcchc2Q69ZB8 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zcchc2Q69ZB8 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Zcchc2Q69ZB8 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zcchc2Q69ZB8 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zcchc2Q69ZB8 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zcchc2Q69ZB8 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zcchc2Q69ZB8 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zcchc2Q69ZB8 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zcchc2Q69ZB8 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zcchc2Q69ZB8 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zcchc2Q69ZB8 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Zcchc2Q69ZB8 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Zcchc2Q69ZB8 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Zcchc2Q69ZB8 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zcchc2Q69ZB8 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zcchc2Q69ZB8 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zcchc2Q69ZB8 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zcchc2Q69ZB8 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zcchc2Q69ZB8 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zcchc2Q69ZB8 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zcchc2Q69ZB8 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zcchc2Q69ZB8 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zcchc2Q69ZB8 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zcchc2Q69ZB8 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zcchc2Q69ZB8 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zcchc2Q69ZB8 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zcchc2Q69ZB8 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zcchc2Q69ZB8 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zcchc2Q69ZB8 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zcchc2Q69ZB8 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zcchc2Q69ZB8 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zcchc2Q69ZB8 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zcchc2Q69ZB8 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zcchc2Q69ZB8 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zcchc2Q69ZB8 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zcchc2Q69ZB8 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zcchc2Q69ZB8 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zcchc2Q69ZB8 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zcchc2Q69ZB8 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zcchc2Q69ZB8 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms