Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

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Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkp4Q68FH0 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkp4Q68FH0 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkp4Q68FH0 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkp4Q68FH0 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkp4Q68FH0 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkp4Q68FH0 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkp4Q68FH0 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkp4Q68FH0 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkp4Q68FH0 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkp4Q68FH0 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkp4Q68FH0 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkp4Q68FH0 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkp4Q68FH0 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkp4Q68FH0 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkp4Q68FH0 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkp4Q68FH0 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkp4Q68FH0 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkp4Q68FH0 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkp4Q68FH0 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkp4Q68FH0 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkp4Q68FH0 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkp4Q68FH0 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkp4Q68FH0 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkp4Q68FH0 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkp4Q68FH0 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkp4Q68FH0 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkp4Q68FH0 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkp4Q68FH0 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkp4Q68FH0 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkp4Q68FH0 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkp4Q68FH0 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkp4Q68FH0 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkp4Q68FH0 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkp4Q68FH0 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkp4Q68FH0 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkp4Q68FH0 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkp4Q68FH0 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkp4Q68FH0 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkp4Q68FH0 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkp4Q68FH0 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkp4Q68FH0 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkp4Q68FH0 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkp4Q68FH0 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkp4Q68FH0 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkp4Q68FH0 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkp4Q68FH0 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkp4Q68FH0 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkp4Q68FH0 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkp4Q68FH0 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkp4Q68FH0 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkp4Q68FH0 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkp4Q68FH0 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkp4Q68FH0 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkp4Q68FH0 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkp4Q68FH0 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkp4Q68FH0 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkp4Q68FH0 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkp4Q68FH0 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkp4Q68FH0 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkp4Q68FH0 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkp4Q68FH0 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkp4Q68FH0 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkp4Q68FH0 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkp4Q68FH0 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkp4Q68FH0 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkp4Q68FH0 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkp4Q68FH0 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkp4Q68FH0 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkp4Q68FH0 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkp4Q68FH0 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkp4Q68FH0 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkp4Q68FH0 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkp4Q68FH0 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkp4Q68FH0 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkp4Q68FH0 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkp4Q68FH0 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkp4Q68FH0 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkp4Q68FH0 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkp4Q68FH0 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkp4Q68FH0 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkp4Q68FH0 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkp4Q68FH0 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkp4Q68FH0 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkp4Q68FH0 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkp4Q68FH0 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkp4Q68FH0 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkp4Q68FH0 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkp4Q68FH0 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkp4Q68FH0 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkp4Q68FH0 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkp4Q68FH0 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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