Protein–RNA interactions for Protein: Q64343

Abcg1, ATP-binding cassette sub-family G member 1, mousemouse

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcg1Q64343 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcg1Q64343 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcg1Q64343 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcg1Q64343 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcg1Q64343 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcg1Q64343 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcg1Q64343 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcg1Q64343 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcg1Q64343 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcg1Q64343 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcg1Q64343 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcg1Q64343 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcg1Q64343 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcg1Q64343 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcg1Q64343 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcg1Q64343 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcg1Q64343 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcg1Q64343 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcg1Q64343 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcg1Q64343 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcg1Q64343 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcg1Q64343 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcg1Q64343 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcg1Q64343 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcg1Q64343 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcg1Q64343 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcg1Q64343 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcg1Q64343 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcg1Q64343 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcg1Q64343 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Abcg1Q64343 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Abcg1Q64343 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Abcg1Q64343 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Abcg1Q64343 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Abcg1Q64343 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Abcg1Q64343 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Abcg1Q64343 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Abcg1Q64343 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Abcg1Q64343 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Abcg1Q64343 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Abcg1Q64343 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Abcg1Q64343 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Abcg1Q64343 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Abcg1Q64343 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Abcg1Q64343 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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Abcg1Q64343 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Abcg1Q64343 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Abcg1Q64343 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Abcg1Q64343 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Abcg1Q64343 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Abcg1Q64343 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Abcg1Q64343 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Abcg1Q64343 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Abcg1Q64343 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Abcg1Q64343 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Abcg1Q64343 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Abcg1Q64343 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Abcg1Q64343 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Abcg1Q64343 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Abcg1Q64343 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Abcg1Q64343 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Abcg1Q64343 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Abcg1Q64343 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Abcg1Q64343 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Abcg1Q64343 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Abcg1Q64343 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Abcg1Q64343 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Abcg1Q64343 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Abcg1Q64343 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Abcg1Q64343 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Abcg1Q64343 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Abcg1Q64343 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Abcg1Q64343 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Abcg1Q64343 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Abcg1Q64343 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Abcg1Q64343 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Abcg1Q64343 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Abcg1Q64343 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Abcg1Q64343 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Abcg1Q64343 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Abcg1Q64343 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Abcg1Q64343 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Abcg1Q64343 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Abcg1Q64343 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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