Protein–RNA interactions for Protein: Q63994

Cd33, Myeloid cell surface antigen CD33, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd33Q63994 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cd33Q63994 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cd33Q63994 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cd33Q63994 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cd33Q63994 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cd33Q63994 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cd33Q63994 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cd33Q63994 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms