Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxa13Q62424 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxa13Q62424 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxa13Q62424 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxa13Q62424 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxa13Q62424 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxa13Q62424 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxa13Q62424 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxa13Q62424 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxa13Q62424 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxa13Q62424 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxa13Q62424 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxa13Q62424 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxa13Q62424 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxa13Q62424 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxa13Q62424 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxa13Q62424 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxa13Q62424 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxa13Q62424 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxa13Q62424 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxa13Q62424 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxa13Q62424 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxa13Q62424 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxa13Q62424 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxa13Q62424 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxa13Q62424 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxa13Q62424 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxa13Q62424 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxa13Q62424 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxa13Q62424 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxa13Q62424 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxa13Q62424 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxa13Q62424 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxa13Q62424 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxa13Q62424 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxa13Q62424 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxa13Q62424 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxa13Q62424 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxa13Q62424 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxa13Q62424 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxa13Q62424 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxa13Q62424 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxa13Q62424 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxa13Q62424 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxa13Q62424 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxa13Q62424 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxa13Q62424 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxa13Q62424 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxa13Q62424 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxa13Q62424 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxa13Q62424 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxa13Q62424 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxa13Q62424 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxa13Q62424 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxa13Q62424 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxa13Q62424 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxa13Q62424 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxa13Q62424 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxa13Q62424 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxa13Q62424 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxa13Q62424 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxa13Q62424 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms