Protein–RNA interactions for Protein: Q62348

Tsn, Translin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TsnQ62348 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TsnQ62348 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TsnQ62348 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TsnQ62348 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TsnQ62348 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TsnQ62348 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TsnQ62348 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TsnQ62348 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TsnQ62348 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TsnQ62348 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TsnQ62348 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TsnQ62348 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TsnQ62348 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TsnQ62348 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TsnQ62348 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TsnQ62348 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TsnQ62348 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TsnQ62348 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TsnQ62348 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TsnQ62348 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TsnQ62348 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TsnQ62348 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TsnQ62348 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TsnQ62348 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TsnQ62348 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TsnQ62348 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TsnQ62348 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TsnQ62348 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TsnQ62348 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TsnQ62348 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TsnQ62348 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TsnQ62348 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TsnQ62348 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TsnQ62348 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TsnQ62348 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TsnQ62348 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TsnQ62348 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TsnQ62348 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TsnQ62348 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TsnQ62348 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TsnQ62348 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TsnQ62348 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TsnQ62348 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TsnQ62348 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TsnQ62348 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TsnQ62348 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TsnQ62348 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TsnQ62348 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TsnQ62348 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TsnQ62348 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TsnQ62348 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TsnQ62348 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TsnQ62348 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
TsnQ62348 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TsnQ62348 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TsnQ62348 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TsnQ62348 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TsnQ62348 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TsnQ62348 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TsnQ62348 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TsnQ62348 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TsnQ62348 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TsnQ62348 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TsnQ62348 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TsnQ62348 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TsnQ62348 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TsnQ62348 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TsnQ62348 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TsnQ62348 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TsnQ62348 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TsnQ62348 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TsnQ62348 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TsnQ62348 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TsnQ62348 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TsnQ62348 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
TsnQ62348 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TsnQ62348 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TsnQ62348 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TsnQ62348 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TsnQ62348 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TsnQ62348 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TsnQ62348 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TsnQ62348 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TsnQ62348 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TsnQ62348 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TsnQ62348 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TsnQ62348 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TsnQ62348 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TsnQ62348 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TsnQ62348 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TsnQ62348 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TsnQ62348 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TsnQ62348 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TsnQ62348 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TsnQ62348 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TsnQ62348 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TsnQ62348 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TsnQ62348 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TsnQ62348 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TsnQ62348 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms