Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sall3Q62255 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sall3Q62255 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sall3Q62255 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Sall3Q62255 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sall3Q62255 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sall3Q62255 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sall3Q62255 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sall3Q62255 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sall3Q62255 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sall3Q62255 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sall3Q62255 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sall3Q62255 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Sall3Q62255 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Sall3Q62255 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sall3Q62255 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sall3Q62255 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Sall3Q62255 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Sall3Q62255 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sall3Q62255 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sall3Q62255 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sall3Q62255 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sall3Q62255 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sall3Q62255 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sall3Q62255 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sall3Q62255 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sall3Q62255 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sall3Q62255 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sall3Q62255 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sall3Q62255 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sall3Q62255 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sall3Q62255 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sall3Q62255 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Sall3Q62255 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sall3Q62255 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sall3Q62255 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sall3Q62255 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sall3Q62255 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sall3Q62255 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sall3Q62255 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sall3Q62255 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Sall3Q62255 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sall3Q62255 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sall3Q62255 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sall3Q62255 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sall3Q62255 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sall3Q62255 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sall3Q62255 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sall3Q62255 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sall3Q62255 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sall3Q62255 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sall3Q62255 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sall3Q62255 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sall3Q62255 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sall3Q62255 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sall3Q62255 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sall3Q62255 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sall3Q62255 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sall3Q62255 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sall3Q62255 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sall3Q62255 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sall3Q62255 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sall3Q62255 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Sall3Q62255 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sall3Q62255 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sall3Q62255 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sall3Q62255 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sall3Q62255 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sall3Q62255 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sall3Q62255 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sall3Q62255 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sall3Q62255 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sall3Q62255 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sall3Q62255 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sall3Q62255 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sall3Q62255 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sall3Q62255 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Sall3Q62255 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Sall3Q62255 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sall3Q62255 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sall3Q62255 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sall3Q62255 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sall3Q62255 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sall3Q62255 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sall3Q62255 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sall3Q62255 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sall3Q62255 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sall3Q62255 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sall3Q62255 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sall3Q62255 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sall3Q62255 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sall3Q62255 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sall3Q62255 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sall3Q62255 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sall3Q62255 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Sall3Q62255 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sall3Q62255 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sall3Q62255 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sall3Q62255 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sall3Q62255 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms