Protein–RNA interactions for Protein: Q61937

Npm1, Nucleophosmin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm1Q61937 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Npm1Q61937 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Npm1Q61937 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Npm1Q61937 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Npm1Q61937 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Npm1Q61937 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Npm1Q61937 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Npm1Q61937 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Npm1Q61937 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Npm1Q61937 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Npm1Q61937 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Npm1Q61937 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Npm1Q61937 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Npm1Q61937 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Npm1Q61937 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Npm1Q61937 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Npm1Q61937 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Npm1Q61937 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Npm1Q61937 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Npm1Q61937 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Npm1Q61937 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Npm1Q61937 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Npm1Q61937 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Npm1Q61937 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Npm1Q61937 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Npm1Q61937 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Npm1Q61937 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Npm1Q61937 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Npm1Q61937 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Npm1Q61937 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Npm1Q61937 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Npm1Q61937 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Npm1Q61937 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Npm1Q61937 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Npm1Q61937 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Npm1Q61937 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Npm1Q61937 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Npm1Q61937 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Npm1Q61937 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Npm1Q61937 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Npm1Q61937 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Npm1Q61937 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Npm1Q61937 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Npm1Q61937 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Npm1Q61937 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Npm1Q61937 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Npm1Q61937 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Npm1Q61937 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Npm1Q61937 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Npm1Q61937 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Npm1Q61937 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Npm1Q61937 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Npm1Q61937 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Npm1Q61937 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Npm1Q61937 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Npm1Q61937 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Npm1Q61937 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Npm1Q61937 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Npm1Q61937 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Npm1Q61937 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Npm1Q61937 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Npm1Q61937 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Npm1Q61937 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Npm1Q61937 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Npm1Q61937 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Npm1Q61937 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Npm1Q61937 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Npm1Q61937 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Npm1Q61937 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Npm1Q61937 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Npm1Q61937 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Npm1Q61937 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Npm1Q61937 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Npm1Q61937 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Npm1Q61937 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Npm1Q61937 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Npm1Q61937 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Npm1Q61937 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Npm1Q61937 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Npm1Q61937 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Npm1Q61937 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Npm1Q61937 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Npm1Q61937 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Npm1Q61937 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Npm1Q61937 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Npm1Q61937 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Npm1Q61937 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Npm1Q61937 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Npm1Q61937 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Npm1Q61937 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Npm1Q61937 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Npm1Q61937 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Npm1Q61937 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Npm1Q61937 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Npm1Q61937 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Npm1Q61937 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Npm1Q61937 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Npm1Q61937 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Npm1Q61937 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Npm1Q61937 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms