Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms