Protein–RNA interactions for Protein: Q60754

Marco, Macrophage receptor MARCO, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MarcoQ60754 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MarcoQ60754 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MarcoQ60754 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MarcoQ60754 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MarcoQ60754 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MarcoQ60754 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MarcoQ60754 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MarcoQ60754 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MarcoQ60754 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MarcoQ60754 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MarcoQ60754 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MarcoQ60754 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MarcoQ60754 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MarcoQ60754 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MarcoQ60754 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MarcoQ60754 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MarcoQ60754 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MarcoQ60754 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MarcoQ60754 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MarcoQ60754 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MarcoQ60754 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MarcoQ60754 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MarcoQ60754 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MarcoQ60754 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MarcoQ60754 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MarcoQ60754 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MarcoQ60754 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MarcoQ60754 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MarcoQ60754 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MarcoQ60754 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MarcoQ60754 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
MarcoQ60754 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MarcoQ60754 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
MarcoQ60754 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MarcoQ60754 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MarcoQ60754 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MarcoQ60754 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MarcoQ60754 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MarcoQ60754 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MarcoQ60754 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.07■□□□□ 0
MarcoQ60754 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MarcoQ60754 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MarcoQ60754 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MarcoQ60754 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MarcoQ60754 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MarcoQ60754 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
MarcoQ60754 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MarcoQ60754 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MarcoQ60754 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MarcoQ60754 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MarcoQ60754 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MarcoQ60754 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MarcoQ60754 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MarcoQ60754 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MarcoQ60754 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MarcoQ60754 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MarcoQ60754 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MarcoQ60754 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MarcoQ60754 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MarcoQ60754 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MarcoQ60754 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MarcoQ60754 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MarcoQ60754 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MarcoQ60754 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MarcoQ60754 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MarcoQ60754 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MarcoQ60754 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MarcoQ60754 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MarcoQ60754 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MarcoQ60754 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MarcoQ60754 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
MarcoQ60754 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MarcoQ60754 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MarcoQ60754 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MarcoQ60754 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MarcoQ60754 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MarcoQ60754 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MarcoQ60754 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MarcoQ60754 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MarcoQ60754 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MarcoQ60754 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MarcoQ60754 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MarcoQ60754 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MarcoQ60754 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MarcoQ60754 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MarcoQ60754 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MarcoQ60754 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MarcoQ60754 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MarcoQ60754 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MarcoQ60754 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MarcoQ60754 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MarcoQ60754 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MarcoQ60754 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MarcoQ60754 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MarcoQ60754 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MarcoQ60754 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MarcoQ60754 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MarcoQ60754 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MarcoQ60754 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MarcoQ60754 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms