Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 Gm14913-201ENSMUST00000120011 1093 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 D530018E20Rik-201ENSMUST00000205107 958 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 AC132446.1-201ENSMUST00000222655 226 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 Gm14542-201ENSMUST00000118460 1248 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 Gm43037-201ENSMUST00000196808 250 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 AC124742.1-201ENSMUST00000219909 547 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Foxd4Q60688 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms