Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CttnQ60598 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CttnQ60598 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CttnQ60598 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CttnQ60598 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CttnQ60598 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CttnQ60598 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CttnQ60598 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CttnQ60598 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CttnQ60598 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CttnQ60598 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CttnQ60598 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CttnQ60598 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms