Protein–RNA interactions for Protein: Q5U3K5

Rabl6, Rab-like protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabl6Q5U3K5 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rabl6Q5U3K5 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rabl6Q5U3K5 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rabl6Q5U3K5 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rabl6Q5U3K5 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rabl6Q5U3K5 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rabl6Q5U3K5 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rabl6Q5U3K5 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rabl6Q5U3K5 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rabl6Q5U3K5 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rabl6Q5U3K5 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rabl6Q5U3K5 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rabl6Q5U3K5 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rabl6Q5U3K5 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rabl6Q5U3K5 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rabl6Q5U3K5 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rabl6Q5U3K5 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rabl6Q5U3K5 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rabl6Q5U3K5 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rabl6Q5U3K5 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rabl6Q5U3K5 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rabl6Q5U3K5 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rabl6Q5U3K5 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Rabl6Q5U3K5 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rabl6Q5U3K5 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Rabl6Q5U3K5 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rabl6Q5U3K5 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rabl6Q5U3K5 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rabl6Q5U3K5 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rabl6Q5U3K5 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rabl6Q5U3K5 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rabl6Q5U3K5 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rabl6Q5U3K5 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rabl6Q5U3K5 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rabl6Q5U3K5 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rabl6Q5U3K5 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rabl6Q5U3K5 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rabl6Q5U3K5 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rabl6Q5U3K5 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rabl6Q5U3K5 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rabl6Q5U3K5 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rabl6Q5U3K5 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rabl6Q5U3K5 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Rabl6Q5U3K5 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rabl6Q5U3K5 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rabl6Q5U3K5 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rabl6Q5U3K5 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rabl6Q5U3K5 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rabl6Q5U3K5 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rabl6Q5U3K5 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rabl6Q5U3K5 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rabl6Q5U3K5 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rabl6Q5U3K5 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rabl6Q5U3K5 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rabl6Q5U3K5 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rabl6Q5U3K5 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Rabl6Q5U3K5 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rabl6Q5U3K5 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rabl6Q5U3K5 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rabl6Q5U3K5 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rabl6Q5U3K5 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rabl6Q5U3K5 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rabl6Q5U3K5 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rabl6Q5U3K5 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rabl6Q5U3K5 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rabl6Q5U3K5 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rabl6Q5U3K5 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rabl6Q5U3K5 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rabl6Q5U3K5 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Rabl6Q5U3K5 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rabl6Q5U3K5 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rabl6Q5U3K5 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rabl6Q5U3K5 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rabl6Q5U3K5 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rabl6Q5U3K5 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rabl6Q5U3K5 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rabl6Q5U3K5 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Rabl6Q5U3K5 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Rabl6Q5U3K5 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rabl6Q5U3K5 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rabl6Q5U3K5 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rabl6Q5U3K5 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rabl6Q5U3K5 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rabl6Q5U3K5 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rabl6Q5U3K5 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rabl6Q5U3K5 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rabl6Q5U3K5 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rabl6Q5U3K5 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rabl6Q5U3K5 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rabl6Q5U3K5 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rabl6Q5U3K5 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rabl6Q5U3K5 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rabl6Q5U3K5 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Rabl6Q5U3K5 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Rabl6Q5U3K5 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Rabl6Q5U3K5 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Rabl6Q5U3K5 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rabl6Q5U3K5 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rabl6Q5U3K5 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rabl6Q5U3K5 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.5 ms