Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC05

Ttf2, Transcription termination factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf2Q5NC05 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttf2Q5NC05 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttf2Q5NC05 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttf2Q5NC05 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttf2Q5NC05 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttf2Q5NC05 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttf2Q5NC05 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttf2Q5NC05 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttf2Q5NC05 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttf2Q5NC05 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttf2Q5NC05 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttf2Q5NC05 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttf2Q5NC05 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttf2Q5NC05 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttf2Q5NC05 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttf2Q5NC05 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttf2Q5NC05 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttf2Q5NC05 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttf2Q5NC05 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttf2Q5NC05 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttf2Q5NC05 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttf2Q5NC05 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttf2Q5NC05 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttf2Q5NC05 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttf2Q5NC05 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttf2Q5NC05 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttf2Q5NC05 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttf2Q5NC05 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttf2Q5NC05 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttf2Q5NC05 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttf2Q5NC05 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttf2Q5NC05 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttf2Q5NC05 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttf2Q5NC05 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttf2Q5NC05 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttf2Q5NC05 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttf2Q5NC05 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttf2Q5NC05 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttf2Q5NC05 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttf2Q5NC05 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttf2Q5NC05 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttf2Q5NC05 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttf2Q5NC05 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttf2Q5NC05 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttf2Q5NC05 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttf2Q5NC05 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttf2Q5NC05 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttf2Q5NC05 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttf2Q5NC05 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttf2Q5NC05 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttf2Q5NC05 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttf2Q5NC05 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttf2Q5NC05 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttf2Q5NC05 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttf2Q5NC05 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttf2Q5NC05 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttf2Q5NC05 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttf2Q5NC05 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttf2Q5NC05 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttf2Q5NC05 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttf2Q5NC05 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttf2Q5NC05 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttf2Q5NC05 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttf2Q5NC05 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttf2Q5NC05 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttf2Q5NC05 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttf2Q5NC05 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttf2Q5NC05 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttf2Q5NC05 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttf2Q5NC05 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttf2Q5NC05 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttf2Q5NC05 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttf2Q5NC05 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttf2Q5NC05 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttf2Q5NC05 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttf2Q5NC05 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttf2Q5NC05 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttf2Q5NC05 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttf2Q5NC05 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttf2Q5NC05 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttf2Q5NC05 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttf2Q5NC05 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttf2Q5NC05 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttf2Q5NC05 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttf2Q5NC05 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttf2Q5NC05 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttf2Q5NC05 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttf2Q5NC05 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttf2Q5NC05 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttf2Q5NC05 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ttf2Q5NC05 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ttf2Q5NC05 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ttf2Q5NC05 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ttf2Q5NC05 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ttf2Q5NC05 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ttf2Q5NC05 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ttf2Q5NC05 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ttf2Q5NC05 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ttf2Q5NC05 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ttf2Q5NC05 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms