Protein–RNA interactions for Protein: Q504M2

Pdp2, MCG53395, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdp2Q504M2 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Pdp2Q504M2 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdp2Q504M2 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Pdp2Q504M2 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdp2Q504M2 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Pdp2Q504M2 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdp2Q504M2 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Pdp2Q504M2 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdp2Q504M2 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdp2Q504M2 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdp2Q504M2 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdp2Q504M2 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Pdp2Q504M2 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Pdp2Q504M2 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Pdp2Q504M2 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdp2Q504M2 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdp2Q504M2 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdp2Q504M2 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Pdp2Q504M2 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdp2Q504M2 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdp2Q504M2 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdp2Q504M2 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdp2Q504M2 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdp2Q504M2 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdp2Q504M2 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdp2Q504M2 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdp2Q504M2 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdp2Q504M2 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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