Protein–RNA interactions for Protein: Q497L1

H2al1n, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1nQ497L1 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2al1nQ497L1 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2al1nQ497L1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2al1nQ497L1 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2al1nQ497L1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
H2al1nQ497L1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2al1nQ497L1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2al1nQ497L1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2al1nQ497L1 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
H2al1nQ497L1 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2al1nQ497L1 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2al1nQ497L1 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2al1nQ497L1 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2al1nQ497L1 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2al1nQ497L1 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2al1nQ497L1 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2al1nQ497L1 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2al1nQ497L1 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2al1nQ497L1 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2al1nQ497L1 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2al1nQ497L1 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2al1nQ497L1 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2al1nQ497L1 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2al1nQ497L1 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2al1nQ497L1 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2al1nQ497L1 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2al1nQ497L1 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2al1nQ497L1 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2al1nQ497L1 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2al1nQ497L1 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2al1nQ497L1 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2al1nQ497L1 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2al1nQ497L1 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2al1nQ497L1 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2al1nQ497L1 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2al1nQ497L1 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2al1nQ497L1 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2al1nQ497L1 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2al1nQ497L1 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2al1nQ497L1 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2al1nQ497L1 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2al1nQ497L1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2al1nQ497L1 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2al1nQ497L1 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2al1nQ497L1 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2al1nQ497L1 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2al1nQ497L1 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2al1nQ497L1 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2al1nQ497L1 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2al1nQ497L1 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2al1nQ497L1 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2al1nQ497L1 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2al1nQ497L1 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2al1nQ497L1 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2al1nQ497L1 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2al1nQ497L1 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2al1nQ497L1 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2al1nQ497L1 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2al1nQ497L1 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2al1nQ497L1 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
H2al1nQ497L1 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2al1nQ497L1 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2al1nQ497L1 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2al1nQ497L1 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2al1nQ497L1 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2al1nQ497L1 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2al1nQ497L1 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2al1nQ497L1 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2al1nQ497L1 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2al1nQ497L1 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2al1nQ497L1 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2al1nQ497L1 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2al1nQ497L1 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2al1nQ497L1 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2al1nQ497L1 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2al1nQ497L1 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2al1nQ497L1 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2al1nQ497L1 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2al1nQ497L1 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2al1nQ497L1 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2al1nQ497L1 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2al1nQ497L1 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
H2al1nQ497L1 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2al1nQ497L1 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2al1nQ497L1 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2al1nQ497L1 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2al1nQ497L1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2al1nQ497L1 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2al1nQ497L1 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2al1nQ497L1 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2al1nQ497L1 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2al1nQ497L1 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2al1nQ497L1 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2al1nQ497L1 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2al1nQ497L1 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2al1nQ497L1 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
H2al1nQ497L1 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2al1nQ497L1 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2al1nQ497L1 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2al1nQ497L1 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms