Protein–RNA interactions for Protein: Q497I4

Krt35, Keratin, type I cuticular Ha5, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt35Q497I4 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt35Q497I4 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt35Q497I4 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt35Q497I4 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt35Q497I4 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt35Q497I4 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt35Q497I4 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt35Q497I4 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt35Q497I4 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt35Q497I4 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt35Q497I4 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt35Q497I4 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt35Q497I4 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt35Q497I4 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt35Q497I4 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt35Q497I4 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt35Q497I4 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt35Q497I4 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt35Q497I4 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt35Q497I4 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt35Q497I4 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt35Q497I4 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt35Q497I4 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt35Q497I4 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt35Q497I4 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt35Q497I4 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt35Q497I4 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt35Q497I4 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt35Q497I4 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Krt35Q497I4 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Krt35Q497I4 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Krt35Q497I4 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt35Q497I4 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt35Q497I4 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt35Q497I4 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt35Q497I4 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt35Q497I4 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt35Q497I4 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt35Q497I4 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt35Q497I4 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt35Q497I4 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt35Q497I4 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt35Q497I4 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt35Q497I4 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt35Q497I4 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt35Q497I4 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt35Q497I4 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt35Q497I4 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt35Q497I4 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt35Q497I4 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt35Q497I4 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt35Q497I4 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt35Q497I4 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt35Q497I4 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt35Q497I4 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt35Q497I4 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt35Q497I4 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt35Q497I4 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt35Q497I4 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt35Q497I4 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt35Q497I4 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt35Q497I4 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt35Q497I4 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt35Q497I4 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt35Q497I4 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt35Q497I4 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt35Q497I4 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt35Q497I4 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt35Q497I4 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt35Q497I4 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt35Q497I4 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt35Q497I4 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt35Q497I4 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt35Q497I4 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt35Q497I4 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt35Q497I4 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt35Q497I4 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt35Q497I4 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt35Q497I4 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt35Q497I4 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt35Q497I4 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt35Q497I4 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt35Q497I4 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt35Q497I4 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt35Q497I4 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt35Q497I4 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt35Q497I4 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt35Q497I4 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt35Q497I4 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt35Q497I4 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt35Q497I4 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt35Q497I4 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt35Q497I4 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt35Q497I4 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt35Q497I4 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt35Q497I4 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt35Q497I4 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt35Q497I4 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt35Q497I4 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt35Q497I4 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms