Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3Q4

Pydc3, Pyrin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pydc3Q3V3Q4 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pydc3Q3V3Q4 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pydc3Q3V3Q4 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pydc3Q3V3Q4 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pydc3Q3V3Q4 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pydc3Q3V3Q4 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pydc3Q3V3Q4 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pydc3Q3V3Q4 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pydc3Q3V3Q4 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pydc3Q3V3Q4 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pydc3Q3V3Q4 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pydc3Q3V3Q4 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pydc3Q3V3Q4 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pydc3Q3V3Q4 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pydc3Q3V3Q4 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pydc3Q3V3Q4 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pydc3Q3V3Q4 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pydc3Q3V3Q4 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pydc3Q3V3Q4 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pydc3Q3V3Q4 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pydc3Q3V3Q4 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pydc3Q3V3Q4 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pydc3Q3V3Q4 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pydc3Q3V3Q4 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pydc3Q3V3Q4 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pydc3Q3V3Q4 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pydc3Q3V3Q4 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pydc3Q3V3Q4 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pydc3Q3V3Q4 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pydc3Q3V3Q4 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pydc3Q3V3Q4 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pydc3Q3V3Q4 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pydc3Q3V3Q4 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pydc3Q3V3Q4 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pydc3Q3V3Q4 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pydc3Q3V3Q4 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pydc3Q3V3Q4 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pydc3Q3V3Q4 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pydc3Q3V3Q4 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pydc3Q3V3Q4 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pydc3Q3V3Q4 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pydc3Q3V3Q4 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pydc3Q3V3Q4 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pydc3Q3V3Q4 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pydc3Q3V3Q4 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pydc3Q3V3Q4 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pydc3Q3V3Q4 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pydc3Q3V3Q4 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pydc3Q3V3Q4 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pydc3Q3V3Q4 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pydc3Q3V3Q4 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pydc3Q3V3Q4 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pydc3Q3V3Q4 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pydc3Q3V3Q4 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pydc3Q3V3Q4 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pydc3Q3V3Q4 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pydc3Q3V3Q4 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pydc3Q3V3Q4 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pydc3Q3V3Q4 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pydc3Q3V3Q4 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pydc3Q3V3Q4 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pydc3Q3V3Q4 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pydc3Q3V3Q4 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Pydc3Q3V3Q4 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pydc3Q3V3Q4 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pydc3Q3V3Q4 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pydc3Q3V3Q4 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pydc3Q3V3Q4 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pydc3Q3V3Q4 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pydc3Q3V3Q4 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Pydc3Q3V3Q4 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pydc3Q3V3Q4 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pydc3Q3V3Q4 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pydc3Q3V3Q4 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pydc3Q3V3Q4 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pydc3Q3V3Q4 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Pydc3Q3V3Q4 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pydc3Q3V3Q4 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Pydc3Q3V3Q4 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pydc3Q3V3Q4 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pydc3Q3V3Q4 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pydc3Q3V3Q4 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pydc3Q3V3Q4 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Pydc3Q3V3Q4 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Pydc3Q3V3Q4 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Pydc3Q3V3Q4 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pydc3Q3V3Q4 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Pydc3Q3V3Q4 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Pydc3Q3V3Q4 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pydc3Q3V3Q4 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pydc3Q3V3Q4 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pydc3Q3V3Q4 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Pydc3Q3V3Q4 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pydc3Q3V3Q4 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pydc3Q3V3Q4 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pydc3Q3V3Q4 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pydc3Q3V3Q4 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pydc3Q3V3Q4 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pydc3Q3V3Q4 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pydc3Q3V3Q4 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms