Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc185Q3V118 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc185Q3V118 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc185Q3V118 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc185Q3V118 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc185Q3V118 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc185Q3V118 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc185Q3V118 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc185Q3V118 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc185Q3V118 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc185Q3V118 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc185Q3V118 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc185Q3V118 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc185Q3V118 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc185Q3V118 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc185Q3V118 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc185Q3V118 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc185Q3V118 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc185Q3V118 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc185Q3V118 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc185Q3V118 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc185Q3V118 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc185Q3V118 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc185Q3V118 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc185Q3V118 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc185Q3V118 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc185Q3V118 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc185Q3V118 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc185Q3V118 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc185Q3V118 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc185Q3V118 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc185Q3V118 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc185Q3V118 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc185Q3V118 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc185Q3V118 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc185Q3V118 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc185Q3V118 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc185Q3V118 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc185Q3V118 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc185Q3V118 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc185Q3V118 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc185Q3V118 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc185Q3V118 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc185Q3V118 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc185Q3V118 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc185Q3V118 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc185Q3V118 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc185Q3V118 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc185Q3V118 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc185Q3V118 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc185Q3V118 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc185Q3V118 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc185Q3V118 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc185Q3V118 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc185Q3V118 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc185Q3V118 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc185Q3V118 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc185Q3V118 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc185Q3V118 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc185Q3V118 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc185Q3V118 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc185Q3V118 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc185Q3V118 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc185Q3V118 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc185Q3V118 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc185Q3V118 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc185Q3V118 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc185Q3V118 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc185Q3V118 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc185Q3V118 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc185Q3V118 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc185Q3V118 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc185Q3V118 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc185Q3V118 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc185Q3V118 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc185Q3V118 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc185Q3V118 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc185Q3V118 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc185Q3V118 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc185Q3V118 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc185Q3V118 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc185Q3V118 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc185Q3V118 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc185Q3V118 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc185Q3V118 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc185Q3V118 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc185Q3V118 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc185Q3V118 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc185Q3V118 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc185Q3V118 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc185Q3V118 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc185Q3V118 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc185Q3V118 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc185Q3V118 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc185Q3V118 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc185Q3V118 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc185Q3V118 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc185Q3V118 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc185Q3V118 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc185Q3V118 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms