Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0I2

Prr7, Proline-rich protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr7Q3V0I2 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prr7Q3V0I2 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prr7Q3V0I2 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prr7Q3V0I2 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prr7Q3V0I2 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prr7Q3V0I2 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prr7Q3V0I2 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prr7Q3V0I2 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prr7Q3V0I2 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prr7Q3V0I2 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prr7Q3V0I2 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prr7Q3V0I2 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prr7Q3V0I2 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prr7Q3V0I2 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prr7Q3V0I2 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prr7Q3V0I2 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prr7Q3V0I2 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Prr7Q3V0I2 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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Prr7Q3V0I2 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Prr7Q3V0I2 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Prr7Q3V0I2 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Prr7Q3V0I2 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Prr7Q3V0I2 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Prr7Q3V0I2 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Prr7Q3V0I2 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Prr7Q3V0I2 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Prr7Q3V0I2 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prr7Q3V0I2 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Prr7Q3V0I2 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prr7Q3V0I2 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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Prr7Q3V0I2 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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Prr7Q3V0I2 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prr7Q3V0I2 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prr7Q3V0I2 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Prr7Q3V0I2 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prr7Q3V0I2 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prr7Q3V0I2 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prr7Q3V0I2 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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Prr7Q3V0I2 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prr7Q3V0I2 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prr7Q3V0I2 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prr7Q3V0I2 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prr7Q3V0I2 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prr7Q3V0I2 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prr7Q3V0I2 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prr7Q3V0I2 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prr7Q3V0I2 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prr7Q3V0I2 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prr7Q3V0I2 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prr7Q3V0I2 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prr7Q3V0I2 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prr7Q3V0I2 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prr7Q3V0I2 4930412F09Rik-201ENSMUST00000139006 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prr7Q3V0I2 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Prr7Q3V0I2 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prr7Q3V0I2 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prr7Q3V0I2 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prr7Q3V0I2 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prr7Q3V0I2 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prr7Q3V0I2 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prr7Q3V0I2 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prr7Q3V0I2 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prr7Q3V0I2 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prr7Q3V0I2 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prr7Q3V0I2 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prr7Q3V0I2 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prr7Q3V0I2 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prr7Q3V0I2 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prr7Q3V0I2 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prr7Q3V0I2 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prr7Q3V0I2 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms