Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0H9

4930596D02Rik, RIKEN cDNA 4930596D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930596D02RikQ3V0H9 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms