Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXZ9

Kdm5a, Lysine-specific demethylase 5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5aQ3UXZ9 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kdm5aQ3UXZ9 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kdm5aQ3UXZ9 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kdm5aQ3UXZ9 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kdm5aQ3UXZ9 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Kdm5aQ3UXZ9 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Kdm5aQ3UXZ9 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Kdm5aQ3UXZ9 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Kdm5aQ3UXZ9 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Kdm5aQ3UXZ9 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Kdm5aQ3UXZ9 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Kdm5aQ3UXZ9 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Kdm5aQ3UXZ9 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Kdm5aQ3UXZ9 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Kdm5aQ3UXZ9 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Kdm5aQ3UXZ9 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Kdm5aQ3UXZ9 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Kdm5aQ3UXZ9 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Kdm5aQ3UXZ9 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Kdm5aQ3UXZ9 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Kdm5aQ3UXZ9 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Kdm5aQ3UXZ9 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Kdm5aQ3UXZ9 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Kdm5aQ3UXZ9 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Kdm5aQ3UXZ9 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Kdm5aQ3UXZ9 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Kdm5aQ3UXZ9 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Kdm5aQ3UXZ9 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Kdm5aQ3UXZ9 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Kdm5aQ3UXZ9 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Kdm5aQ3UXZ9 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Kdm5aQ3UXZ9 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Kdm5aQ3UXZ9 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Kdm5aQ3UXZ9 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Kdm5aQ3UXZ9 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Kdm5aQ3UXZ9 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Kdm5aQ3UXZ9 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Kdm5aQ3UXZ9 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Kdm5aQ3UXZ9 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Kdm5aQ3UXZ9 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Kdm5aQ3UXZ9 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Kdm5aQ3UXZ9 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Kdm5aQ3UXZ9 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Kdm5aQ3UXZ9 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Kdm5aQ3UXZ9 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Kdm5aQ3UXZ9 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Kdm5aQ3UXZ9 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Kdm5aQ3UXZ9 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Kdm5aQ3UXZ9 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Kdm5aQ3UXZ9 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Kdm5aQ3UXZ9 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Kdm5aQ3UXZ9 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Kdm5aQ3UXZ9 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Kdm5aQ3UXZ9 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Kdm5aQ3UXZ9 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Kdm5aQ3UXZ9 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Kdm5aQ3UXZ9 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Kdm5aQ3UXZ9 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Kdm5aQ3UXZ9 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Kdm5aQ3UXZ9 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Kdm5aQ3UXZ9 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Kdm5aQ3UXZ9 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Kdm5aQ3UXZ9 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Kdm5aQ3UXZ9 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Kdm5aQ3UXZ9 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Kdm5aQ3UXZ9 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Kdm5aQ3UXZ9 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Kdm5aQ3UXZ9 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Kdm5aQ3UXZ9 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Kdm5aQ3UXZ9 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Kdm5aQ3UXZ9 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Kdm5aQ3UXZ9 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Kdm5aQ3UXZ9 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Kdm5aQ3UXZ9 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Kdm5aQ3UXZ9 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Kdm5aQ3UXZ9 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Kdm5aQ3UXZ9 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Kdm5aQ3UXZ9 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Kdm5aQ3UXZ9 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Kdm5aQ3UXZ9 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Kdm5aQ3UXZ9 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Kdm5aQ3UXZ9 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Kdm5aQ3UXZ9 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Kdm5aQ3UXZ9 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Kdm5aQ3UXZ9 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Kdm5aQ3UXZ9 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Kdm5aQ3UXZ9 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Kdm5aQ3UXZ9 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Kdm5aQ3UXZ9 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Kdm5aQ3UXZ9 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Kdm5aQ3UXZ9 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Kdm5aQ3UXZ9 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Kdm5aQ3UXZ9 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Kdm5aQ3UXZ9 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Kdm5aQ3UXZ9 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Kdm5aQ3UXZ9 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Kdm5aQ3UXZ9 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Kdm5aQ3UXZ9 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Kdm5aQ3UXZ9 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Kdm5aQ3UXZ9 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms