Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWX6

E330034G19Rik, RIKEN cDNA E330034G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330034G19RikQ3UWX6 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms