Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT54

Obox3, Oocyte-specific homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Obox3Q3UT54 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Obox3Q3UT54 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Obox3Q3UT54 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Obox3Q3UT54 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Obox3Q3UT54 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Obox3Q3UT54 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Obox3Q3UT54 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Obox3Q3UT54 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Obox3Q3UT54 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Obox3Q3UT54 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Obox3Q3UT54 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Obox3Q3UT54 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Obox3Q3UT54 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Obox3Q3UT54 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Obox3Q3UT54 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Obox3Q3UT54 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Obox3Q3UT54 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Obox3Q3UT54 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Obox3Q3UT54 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Obox3Q3UT54 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Obox3Q3UT54 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Obox3Q3UT54 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Obox3Q3UT54 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Obox3Q3UT54 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Obox3Q3UT54 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Obox3Q3UT54 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Obox3Q3UT54 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Obox3Q3UT54 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Obox3Q3UT54 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Obox3Q3UT54 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Obox3Q3UT54 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Obox3Q3UT54 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Obox3Q3UT54 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Obox3Q3UT54 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Obox3Q3UT54 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Obox3Q3UT54 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Obox3Q3UT54 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Obox3Q3UT54 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Obox3Q3UT54 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Obox3Q3UT54 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Obox3Q3UT54 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Obox3Q3UT54 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Obox3Q3UT54 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Obox3Q3UT54 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Obox3Q3UT54 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Obox3Q3UT54 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Obox3Q3UT54 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Obox3Q3UT54 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Obox3Q3UT54 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Obox3Q3UT54 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Obox3Q3UT54 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Obox3Q3UT54 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Obox3Q3UT54 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Obox3Q3UT54 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Obox3Q3UT54 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Obox3Q3UT54 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Obox3Q3UT54 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Obox3Q3UT54 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Obox3Q3UT54 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Obox3Q3UT54 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Obox3Q3UT54 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Obox3Q3UT54 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Obox3Q3UT54 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Obox3Q3UT54 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Obox3Q3UT54 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Obox3Q3UT54 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Obox3Q3UT54 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Obox3Q3UT54 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Obox3Q3UT54 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Obox3Q3UT54 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Obox3Q3UT54 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Obox3Q3UT54 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Obox3Q3UT54 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Obox3Q3UT54 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Obox3Q3UT54 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Obox3Q3UT54 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Obox3Q3UT54 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Obox3Q3UT54 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Obox3Q3UT54 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Obox3Q3UT54 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Obox3Q3UT54 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Obox3Q3UT54 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Obox3Q3UT54 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Obox3Q3UT54 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Obox3Q3UT54 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Obox3Q3UT54 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Obox3Q3UT54 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Obox3Q3UT54 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Obox3Q3UT54 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Obox3Q3UT54 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Obox3Q3UT54 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Obox3Q3UT54 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Obox3Q3UT54 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Obox3Q3UT54 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Obox3Q3UT54 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Obox3Q3UT54 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Obox3Q3UT54 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Obox3Q3UT54 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Obox3Q3UT54 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Obox3Q3UT54 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms