Protein–RNA interactions for Protein: Q3US96

Gm10735, Predicted gene 10735, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10735Q3US96 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm10735Q3US96 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm10735Q3US96 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm10735Q3US96 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm10735Q3US96 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm10735Q3US96 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm10735Q3US96 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm10735Q3US96 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm10735Q3US96 Gm14435-201ENSMUST00000108995 643 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm10735Q3US96 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm10735Q3US96 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm10735Q3US96 Tm6sf1-202ENSMUST00000119543 1066 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm10735Q3US96 C330021F23Rik-204ENSMUST00000151633 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm10735Q3US96 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm10735Q3US96 Vmn1r206-201ENSMUST00000187140 1135 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm10735Q3US96 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm10735Q3US96 Gm44840-201ENSMUST00000208983 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm10735Q3US96 Olfr838-ps1-201ENSMUST00000211872 977 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm10735Q3US96 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm10735Q3US96 4930584E12Rik-201ENSMUST00000216646 981 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm10735Q3US96 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm10735Q3US96 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm10735Q3US96 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm10735Q3US96 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm10735Q3US96 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm10735Q3US96 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm10735Q3US96 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm10735Q3US96 C330021F23Rik-201ENSMUST00000086479 1111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm10735Q3US96 Vmn1r4-201ENSMUST00000096612 1034 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm10735Q3US96 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm10735Q3US96 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm10735Q3US96 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm10735Q3US96 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm10735Q3US96 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm10735Q3US96 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm10735Q3US96 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm10735Q3US96 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm10735Q3US96 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm10735Q3US96 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm10735Q3US96 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm10735Q3US96 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm10735Q3US96 Aadac-201ENSMUST00000029325 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm10735Q3US96 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm10735Q3US96 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm10735Q3US96 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm10735Q3US96 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm10735Q3US96 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm10735Q3US96 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm10735Q3US96 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm10735Q3US96 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm10735Q3US96 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm10735Q3US96 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm10735Q3US96 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm10735Q3US96 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm10735Q3US96 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm10735Q3US96 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm10735Q3US96 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm10735Q3US96 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm10735Q3US96 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm10735Q3US96 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm10735Q3US96 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm10735Q3US96 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm10735Q3US96 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm10735Q3US96 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm10735Q3US96 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm10735Q3US96 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm10735Q3US96 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm10735Q3US96 Gm14539-201ENSMUST00000117527 174 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm10735Q3US96 4933403O08Rik-201ENSMUST00000132037 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm10735Q3US96 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm10735Q3US96 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm10735Q3US96 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm10735Q3US96 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm10735Q3US96 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm10735Q3US96 AC162940.1-201ENSMUST00000224745 1167 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm10735Q3US96 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm10735Q3US96 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm10735Q3US96 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm10735Q3US96 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm10735Q3US96 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm10735Q3US96 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm10735Q3US96 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm10735Q3US96 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm10735Q3US96 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm10735Q3US96 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm10735Q3US96 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm10735Q3US96 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm10735Q3US96 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm10735Q3US96 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm10735Q3US96 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm10735Q3US96 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm10735Q3US96 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm10735Q3US96 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm10735Q3US96 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm10735Q3US96 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm10735Q3US96 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm10735Q3US96 Il15ra-205ENSMUST00000114833 1607 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm10735Q3US96 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm10735Q3US96 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm10735Q3US96 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms