Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Znf48Q3US17 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Znf48Q3US17 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Znf48Q3US17 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Znf48Q3US17 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Znf48Q3US17 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Znf48Q3US17 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Znf48Q3US17 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Znf48Q3US17 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Znf48Q3US17 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Znf48Q3US17 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Znf48Q3US17 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Znf48Q3US17 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Znf48Q3US17 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Znf48Q3US17 Ccl25-201ENSMUST00000024004 1058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Znf48Q3US17 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Znf48Q3US17 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Znf48Q3US17 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Znf48Q3US17 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Znf48Q3US17 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Znf48Q3US17 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Znf48Q3US17 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Znf48Q3US17 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Znf48Q3US17 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Znf48Q3US17 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Znf48Q3US17 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Znf48Q3US17 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Znf48Q3US17 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Znf48Q3US17 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Znf48Q3US17 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Znf48Q3US17 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Znf48Q3US17 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Znf48Q3US17 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Znf48Q3US17 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Znf48Q3US17 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Znf48Q3US17 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Znf48Q3US17 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Znf48Q3US17 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Znf48Q3US17 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Znf48Q3US17 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Znf48Q3US17 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Znf48Q3US17 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Znf48Q3US17 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Znf48Q3US17 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Znf48Q3US17 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Znf48Q3US17 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Znf48Q3US17 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Znf48Q3US17 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Znf48Q3US17 Gm10701-201ENSMUST00000098926 906 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Znf48Q3US17 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Znf48Q3US17 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Znf48Q3US17 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Znf48Q3US17 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Znf48Q3US17 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Znf48Q3US17 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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